Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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