Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Depp1Q8K2F3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Depp1Q8K2F3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms