Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms