Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Abcf3Q8K268 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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