Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek9Q8K1R7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nek9Q8K1R7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Nek9Q8K1R7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nek9Q8K1R7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nek9Q8K1R7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nek9Q8K1R7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms