Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms