Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Card11Q8CIS0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Card11Q8CIS0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms