Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tph2Q8CGV2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tph2Q8CGV2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms