Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxw17Q8CFE8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fbxw17Q8CFE8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms