Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms