Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CD60 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Q8CD60 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Q8CD60 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CD60 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CD60 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CD60 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CD60 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CD60 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CD60 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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