Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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