Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms