Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2K1

Def6, Differentially expressed in FDCP 6, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def6Q8C2K1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def6Q8C2K1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms