Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pgam5Q8BX10 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pgam5Q8BX10 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms