Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fbxo38Q8BMI0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fbxo38Q8BMI0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fbxo38Q8BMI0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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