Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop53Q8BK35 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nop53Q8BK35 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nop53Q8BK35 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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