Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp1Q8BJQ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp1Q8BJQ2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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