Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms