Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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