Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ChfrQ810L3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms