Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcsk9Q80W65 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Pcsk9Q80W65 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pcsk9Q80W65 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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