Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc29Q80VM3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc29Q80VM3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc29Q80VM3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc29Q80VM3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc29Q80VM3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc29Q80VM3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc29Q80VM3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms