Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo2Q7TSY8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo2Q7TSY8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms