Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms