Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

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Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ckap2lQ7TS74 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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