Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms