Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nphp3Q7TNH6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms