Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2aQ7TMM9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms