Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TwistnbQ78WZ7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms