Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms