Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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