Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms