Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms