Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cxcl3Q6W5C0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms