Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Flrt1Q6RKD8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms