Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcsamQ6RFH4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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