Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d2Q6PHS9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms