Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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