Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtifQ6PEE2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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