Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb39Q6PDK0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb39Q6PDK0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms