Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim37Q6PCX9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trim37Q6PCX9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trim37Q6PCX9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim37Q6PCX9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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