Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms