Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms