Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms