Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rftn1Q6A0D4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms