Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrrc8eQ66JT1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrrc8eQ66JT1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms