Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2bQ64511 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms