Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e1Q64104 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms