Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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